Действие разворачивается в Соединённом Королевстве, в самом сердце ночного Лондона. Главная героиня, Хатори, получает посылку, которая меняет её жизнь. До этого момента её существование было наполнено страданиями. Мать, неспособная принять свою странную дочь, однажды решает покончить с собой. Хатори, которую все зовут Чисэ, с детства видит странных существ, окружающих её повсюду. Эти создания имеют отталкивающий вид и преследуют её в самых обычных ситуациях: за завтраком, на прогулке, даже во сне. Люди, пытавшиеся заботиться о девочке, быстро отказывались от неё, не понимая её поведения.
Однажды, чтобы спастись от преследований, Чисэ убегает в лес. Там она находит странное здание, внутри которого располагается огромная библиотека. В этом месте она встречает человека, который, в отличие от всех остальных, понимает, что с ней происходит. Он объясняет, что эти существа не могут проникнуть сюда, а его задача — охранять лес. Впервые за долгое время Чисэ чувствует себя в безопасности. Этот незнакомец становится для неё проводником в мир, где она сможет обрести покой и избавиться от своих страхов. С этого момента её жизнь начинает меняться, наполняясь новыми приключениями и открытиями.
Чисэ постепенно учится справляться с тем, что её окружает, и находит в себе силы противостоять ужасам, преследовавшим её всю жизнь. Новый знакомый помогает ей не только понять себя, но и обрести уверенность. Вместе они исследуют тайны леса и библиотеки, сталкиваясь с неожиданными испытаниями. История Чисэ — это путь от страха и одиночества к принятию себя и обретению внутреннего спокойствия. Её приключения становятся символом борьбы с внутренними демонами и поиска своего места в мире, где всё не так, как кажется на первый взгляд.