Макото Юки, обычный парень, переводится в частную академию Гэккокан, где его жизнь резко меняется. Однажды он сталкивается с загадочным существом, известным как Тень, и в этот момент в нем пробуждается необычная сила — способность вызывать Персону. Это привлекает внимание членов тайного школьного клуба SEES, которые уже давно ведут борьбу с этими монстрами. Несмотря на свою привычную отстраненность, Макото соглашается присоединиться к ним, даже не подозревая, как сильно изменится его жизнь.
С наступлением лета команда SEES продолжает свои исследования и сражения, постепенно приближаясь к разгадке тайны «Темного часа». Макото, который всегда держался особняком, начинает чувствовать связь с новыми товарищами. Однако чем ближе они подходят к цели, тем сильнее его беспокойство. Юноша понимает, что может потерять то, что стало для него настоящим домом — место, где он нашел друзей и смысл своего существования.
Битва с Тенями становится все сложнее, а отношения внутри команды — крепче. Макото, привыкший к одиночеству, теперь не может представить себя без этих людей. Но чем ближе разгадка, тем больше он боится, что все, что он обрел, может исчезнуть. Впереди его ждут не только сражения, но и выбор, который определит судьбу не только его, но и всех, кто ему дорог.
