Земля оказалась под властью инопланетных захватчиков, стремящихся установить полный контроль над планетой. Жителям Японии сообщили, что большая часть человечества погибла, а выжившие вынуждены существовать в строго ограниченных условиях. Токио превратился в закрытый город, окруженный непроницаемыми барьерами. Выход за его пределы строго запрещен, а за нарушение этого правила грозит суровое наказание. Камина Аято, недавний выпускник школы, живет с матерью, которая полностью погружена в работу, забывая о семейных обязанностях. Это приводит к постоянным конфликтам между ними, которые лишь усугубляют и без того напряженную обстановку.
На планете осталось менее двадцати миллионов человек, но ситуация продолжает ухудшаться. Внезапно вспыхнула новая война, и армия начала использовать мощное оружие против неизвестного врага. Токио охвачен паникой, и в этот момент Аято встречает загадочную женщину. Она предлагает ему управлять Ра-Зефоном — уникальным роботом, обладающим невероятной силой. С его помощью Аято получает шанс защитить своих близких и друзей, которым грозит смертельная опасность.
С каждым днем угроза становится все серьезнее, и Аято понимает, что только он может изменить ход событий. Его сила растет, но вместе с ней приходят и новые испытания. Теперь он должен не только сражаться с врагами, но и разобраться в себе, чтобы найти ответы на вопросы, которые давно мучают его. Сможет ли он спасти тех, кто ему дорог, и остановить надвигающуюся катастрофу? Время на исходе, и каждый шаг может стать решающим.